Emanuel Canes was een zoon van Jesaias Canes en Matje Fransman. Hij huwde Rachel Pijnappel in 1891. Zij overleed in 1915. Ze kregen negen kinderen: Salomon Canes Matje Schelvis-Canes Jesaija Canes Mietje Canes Joseph Canes Heintje Querido-Canes Mozes Canes Nathan Canes en een kind dat jong overleed.
In 1918 hertrouwde Emanuel met Aaltje Blog in Amsterdam met wie hij nog een kind kreeg…