Salomo Aptroot was een zoon van Heiman Aptroot en Esther van Hasselt. In 1910 trouwde hij met Betje van Gelder, dochter van Barend van Gelder en Grietje Eva Goudvis. Betje overleed in 1933. Salomo en Betje hadden twee zonen.
In 1935 trouwde Salomo met Caroline Sabella Rijnveld.