Meijer is een zoon van Michiel Zegerius en Rachel Vieijra. Hij trouwde 25 februari 1914 met Chrisje Scheffer (18 jaar), dochter van Gerrit Scheffer en Schoontje de Haas.
Meijer Zegerius en Chrisje Scheffer hadden ook de volgende kinderen: Michel, Rachel en Schoontje. Een zoon, Gerrit, stierf voor de oorlog. Toevoeging van een bezoeker van de website
Van dit gezin is ook een JOKOS-dossier (nummer 6477) aanwezig op het Gemeentearchief van Amsterdam. Voor inzage is toestemming nodig van de stichting Joods Maatschappelijk Werk.