Meijer Witteboon was een zoon van Nathan Witteboon en Schoontje van Praag. Hij trouwde in Amsterdam op 6 September 1906 met Eva Schellevis, die echter op 30 October 1933 overleed.
Het echtpaar kreeg zeven kinderen waarvan Eva op 1-jarige leeftijd in 1909 overleed. De andere kinderen waren Nathan, (die op 21 November 1936 overleed en gehuwd was met Rachel de Lange), Philip, Andries en de nog thuis…