Jozef besluit begin 1943 naar veiliger oorden te vluchten, maar wordt op 27 maart 1943 in Perpignan (FR), aan de Spaanse grens aangehouden.
Vervolgens wordt Jozef Goudvis in een verzamelcentrum van Tournon d'Agenais ondergebracht. Vandaaruit wordt hij op 25 juni 1943 in Compiègne op transport naar Buchenwald gesteld:
http://www.bddm.org/liv/details.php?id=I.110.#GOUDVIS
Op geen van zijn kampkaarten staat vermeld dat hij Joods is. Mogelijk heeft hij dat verborgen weten te houden.