Samuel is een zoon van Arron Nikkelsberg en Mijntje van Lochem. Hij trouwde 1 september 1910 met Jansje Peperwortel (A'dam, 14 april 1882), dochter van Joseph Samson Peperwortel en Marianne Blitz (A'dam, 23 januari 1842).
Er staan geen kinderen vermeld op de archiefkaart.
Bron SAA archiefkaart Samuel Nikkelsberg 7-9-1884 en archiefkaart Jansje Peperwortel 14-4-1882