In de oorlog dook Sara onder. Ze werd door verraad van de beruchte Haagse Jodenjager Maarten Spaans gearresteerd. Ze kwam via het Oranjehotel in Scheveningen in Westerbork terecht. Zij werd op 24 september 1943 in Auschwitz vermoord.
Haar ex-man Berthold Eisendrath werd op 21 januari 1943 in Auschwitz vermoord.