Werner Pfeffer was de enige zoon van Fritz Pfeffer en Vera Bythiner, zijn eerste vrouw. Nadat het huwelijk van Fritz en Vera in 1933 op een scheiding was uitgelopen, kreegt Fritz de voogdij over Werner toegewezen. Hij had een hulp in de huishouding, Else Messmer, die ook regelmatig op Werner paste. Na de Kristallnacht van 9 op 10 november 1938, besloot Fritz Pfeffer om Duitsland te verlaten. Hij zorgde ervoor dat zijn zoon Werner met een Kindertransport naar Hoek van Holland kon en vanaf daar met de boot naar Engeland. Volgens een verklaring zette mevrouw Messmer hem op de boot; volgens een andere verklaring was het Charlotte Kaletta, de vriendin van Fritz Pfeffer, die dit deed.
Zijn zoon Werner Peter Pfeffer vertrok na de oorlog naar de Verenigde Staten. Hij bouwde daar vanaf 1952 een handelszaak op. Hij overleed op 14 februari 1995 in California (USA).
Bron: annefrank.org/nl