Emanuel Elzas was getrouwd met Anna Rosina Elzas-Smeer. Ze zijn getrouwd op 28 december 1932 te Amsterdam.
Het echtpaar is gescheiden 13 augustus 1949 te Amsterdam.
Meer over het gezin in de oorlog, kunt u hier lezen: Het familieverhaal van koordirigent Meijer Smeer, oorlogsjaren.
Emanuel en Anna Rosina hadden twee kinderen: Vera en Eduard Martin (hij werd geboren in Toulouse). Beide kinderen overleefden de oorlog.