Isaäc Verdooner was een zoon van Tobias Verdooner en Margaretha Cohen Bromet. Hij huwde Rebecca Wertheim in 1898 in Amsterdam. Zij overleed in 1927. Ze kregen in ieder geval tien kinderen, onder wie Margaretha. Isaäc Verdooner hertrouwde in 1930 met Leena Kampion.
Stadsarchief Amsterdam, archiefkaart Isaac Verdooner