Josef Müller is op 16 april 1943 in het kamp Westerbork omgekomen en op 19 april 1943 gecremeerd. De urn met zijn as is op de joodse begraafplaats in Diemen op veld U, rij 2, graf nr. 29 bijgezet.
Register van joden die in het kamp Westerbork zijn gecremeerd, 1943-1944; archief van de gemeente Westerbork, opgenomen in het archief van de gemeente Midden-Drenthe te Beilen, inv. n 3789
Lijst van in de concentratiekampen Westerbork en Buchenwald overleden Joodsche Personen die op Nederlandsche begraafplaatsen ter aarde werden besteld; NIOD, archief Westerbork, port. 1, map 1