Philip Emden is op 1 juni 1943 afgevoerd naar Westerbork. Volgens het gemeentearchief Amsterdam, maar op de kaarten van Westerbork staat dat hij 15 april 1943 is aangekomen en verbleef in Barak 30
Gelijk naar aankomst in het kamp, is hij een procedure gestart om vrijgelaten te worden. Dit omdat hij getrouwd was met een arische vrouw en volgens de op dat moment geldende regels mocht hij niet worden opgepakt.
Hij werd ontslagen uit het kamp op 21 juli 1943.