Het theater was in 1941 onder de naam Joodse Schouwburg één van de weinige plekken waar joodse artiesten mochten optreden en waar joden als publiek mochten vertoeven. Alle andere uitgaansgelegenheden waren voor joden verboden.
Vanaf oktober 1942 werd de Schouwburg, die geassocieerd werd met ontspanning en vermaak, bestemd tot verzamelplaats van Amsterdamse joden. Na ontvangst van een oproep voor Arbeitseinsatz moest men zich daar melden. Het gebeurde ook dat bij razzia’s grote groepen joden bij de Schouwburg werden afgeleverd.
Na een kort verblijf in de Schouwburg werden zij met achtereenvolgens tram en trein naar Westerbork vervoerd. In de periode tot september 1943 hebben 60.000 tot 80.000 joden op deze manier Amsterdam verlaten.
De interne coördinatie van de Hollandsche Schouwburg was door de Joodse Raad toevertrouwd aan Walter Süskind. Voor de jongste kinderen organiseerde hij een crèche aan de overkant van de straat.
Tegenwoordig is de Hollandsche Schouwburg een monument, zie: www.hollandscheschouwburg.nl.