Philip Witteboon was een zoon van Meijer Witteboon en Eva Schellevis. Hij trouwde op 29 Juli 1936 in Amsterdam met Henriette Blits, dochter van Nathan Blits en Esther Halberstadt.
Het echtpaar kreeg één zoon: Nathan.
Stadsarchief Amsterdam, archiefkaat Philip Witteboon en Henriette Blits.