Nathan is een zoon van Juda Loonstijn en Aaltje Scheffer. Hij trouwde 14 oktober 1925 met Jansje Tulp (24 jaar), dochter van Abraham Tulp en Sara Hoed.
In addition, a Jokos file (number 13749) on this family is at the Amsterdam Municipal Archive. Access is subject to authorization from the Stichting Joods Maatschappelijk Werk.