Nathan is een zoon van Salomon Peperwortel en Betje Cohen. Hij trouwde 16 juni 1920 met Saartje Gobetz (20 jaar), dochter van Joseph Gobetz en Klara Klijnkramer.
Bron wiewaswie.nl (huwelijk Saartje Gobetz en Nathan Peperwortel)
In addition, a Jokos file (number 3036) on this family is at the Amsterdam Municipal Archive. Access is subject to authorization from the Stichting Joods Maatschappelijk Werk.
In het Proces-Verbaal naar aanleiding van de dood van WA-man Koot op 11 februari 1941 bevindt zich een verklaring van Nathan Peperwortel. Dit proces-verbaal bevindt zich op het Stadsarchief Amsterdam. Zijn adres is hierin Waterlooplein 87-I i.p.v. 89-I.