Emanuel Mechanicus trouwde in 1901 met Elise Coltof (geb. 1870) die in 1937 overleed.
Uit dit huwelijk werd in 1902 Abraham André Mechanicus geboren en in 1911 Bernhard Mechanicus. Beide zoons vertrokken naar Antwerpen en overleefden de oorlog.
Op 29 maart 1939 hertrouwde Emanuel Mechanicus met Roosje Druk (geb. 1879).