Nathan Sarfatij was een zoon van Isaac Sarfatij en Rebekka Polk. Hij huwde Maria Petronella Clasina van Kasteren in 1917 in Amsterdam. Zij overleed op 23 mei 1942. Ze kregen twee kinderen. Vanaf 1929 woonden ze niet meer samen.
Stadsarchief Amsterdam, archiefkaart Nathan Sarfatij